鸡粪含有大量的微生物有害细菌，不能直接施用，必须进行深度高温发酵。某些发酵的目的主要有两种，一种是杀死有害细菌，另一种是组织尚未完全消化的物质，增加实际有机物的含量。

发酵主要在发酵罐内进行，即在酵母中积累鸡粪，同时添加适量的发酵菌，然后再用农膜覆盖，通常发酵时间为10×20d。

       经过深度发酵后，鸡粪被烘干并粉碎。鸡粪碎屑可以直接施用，但只被称为传统的农用肥料，不能称为商品化有机肥。

        然而，如果要生产商用有机肥料，将执行NY525-2002标准。根据该标准，NPK的总含量必须大于或等于4%，有机质必须大于或等于30%，水分必须小于或等于20%，PH值必须为5.5%。当然，还有其他要求，如五种重金属的含量不应超过标准，蛔虫卵死亡率和大肠菌群值需要达到标准。

       只有按照上述要求，才是合格的有机肥料。从外观上看，商用有机肥料分为粉末和颗粒。工业有机肥要生产成颗粒，还必须进行造粒。有机肥造粒生产设备一般采用盘式造粒，包括计量设备、实验室设备、混合设备、造粒设备、干燥设备、筛分设备、灌装设备、缝纫包装设备。